南京的三本大学主要有东南大学成贤学院、南京大学金陵学院、南京理工大学紫金学院、南京航空航天大学金城学院、南京理工大学泰州科技学院、南京师范大学泰州学院、中国传媒大学南广学院、南京医科大学康达学院、南京信息工程大学滨江学院、南京审计学院的金审学院、南京师范大学中北学院、南京工业大学浦江学院、南京体育学院（按民办机制招生收费）、三江学院等。
南京最好的三本院校
1、东南大学成贤学院：始创于1998年，2003年经教育部批准更用现名。坐落于南京市，是经国家教育部批准成立的全日制普通本科高校，由“985”“211”重点建设高校――东南大学在培养高水平应用型人才、服务国家和社会经济发展层面，用全新的办学理念和运行模式举办的独立学院。
2、南京邮电大学通达学院：位于江苏扬州，是经国家教育部批准，由南京邮电大学1999年创办的全日制本科独立学院。2012年，根据江苏省委、省*关于优化全省高等教育结构和布局的调整方案，南京邮电大学与扬州市人民*合作，在荣获联合国人居奖、素有“淮左名都，竹西佳处”之称的历史文化名城扬州共建新校区。
3、南京师范大学中北学院：经中华人民共和国教育部批准，百年名校南京师范大学下属的二级独立学院，是由南师大和南师大教育发展基金会合办的，于南京师范大学组织教学。南师大中北学院自1999年建院以来，秉承百年老校――南京师范大学优良的办学传统和先进的教育理念，依托南京师范大学的优质教学资源，独立组织教学，是南京师范大学本科生培养的有机组成部分。
4、南京航空航天大学金城学院：南京航空航天大学联合社会力量于1999年经原中国航空工业总公司和江苏省教育委员会批准成立的公有二级学院，2004年经教育部批准，学院改制为相对独立的二级学院。学院坐落于南京市江宁经济开发区，校园占地856亩，在校生达13000余人。
5、中国传媒大学南广学院：经国家教育部批准，由中国传媒大学原校长、荣誉校长刘继南带领的中国传媒大学和著名文化企业家、国内影视业领军人物、民办教育家蒲树林先生联合创办，于2004年在江苏省南京市设立的一所非营利独立学院。
江苏最值得上的三本大学
南京大学金陵学院：经国家教育部批准由南京大学申办的本科层次的独立学院。学校传承百年名校——南京大学的办学传统和办学理念，依托南京大学的优质教育资源，培养高素质具有创新精神的应用型人才。校园风景秀丽，环境优美，被誉为“南京最美的十所高校”之一。
江苏科技大学苏州理工学院：前身为江苏科技大学南徐学院，2012年经教育部和江苏省教育厅批准正式更名为江苏科技大学苏州理工学院，是全日制普通本科院校（独立学院）。
东南大学成贤学院：位于江苏省南京市，是经中华人民共和国教育部批准、由东南大学举办的全日制普通本科高校（独立学院）。